Die Publikationen der Ornithologischen Gesellschaft in Bayern spiegeln die Geschichte und Trendwendungen in der Vogelkunde wider. In der ersten Hälfte unseres Jahrhunderts stand die Erforschung naher und ferner Vogellebensräume und die Beschreibung neuer Vogelarten im Vordergrund. Die sechziger Jahre waren mehr der Verhaltensforschung gewidmet, in den siebziger Jahren gewannen Umwelteinflüsse auf die Vogelwelt an Bedeutung, womit die Grundlagen für die Berücksichtigung ornithologischer Belange in der Landschaftsplanung und in mittlerweile gesetzlich vorgeschriebenen Umweltverträglichkeitsprüfungen gelegt wurden.

Als Meilenstein für die bayerische Vogelkunde ist die im Auftrag der Ornithologischen Gesellschaft in Bayern mit Unterstützung der Bayerischen Akademie der Wissenschaften und der Stiftung zur Förderung der Wissenschaften in Bayern von W. Wüst herausgegebenen "Avifauna Bavariae - die Vogelwelt Bayerns im Wandel der Zeit" (Bd.1 1981, Bd.2 1986) zu nennen. Sie ist, nach A. J. Jäckels "Systematische Übersicht der Vögel Bayerns - mit Rücksicht auf das örtliche und quantitative Leben der Vögel, ihre Lebensweise, ihren Zug und ihre Abänderungen" von 1891, die einzige zusammenfassende Darstellung des avifaunistischen Wissens über die Vogelwelt Bayerns.

Fast gleichzeitig erschien 1987, als Ergebnis der jahrelangen Untersuchungen einer Vielzahl von Mitgliedern und in Zusammenarbeit mit dem Bayerischen Landesamt für Umweltschutz, der "Atlas der Brutvögel Bayerns 1979-1983".

In den Jahren 1995 bis 2005 stand als ein wichtiges Vorhaben die Fortschreibung dieses Bayerischen Brutvogelatlasses an. Ab 1995 erarbeitete die Ornithologische Gesellschaft in Bayern e.V., zusammen mit dem Bayerischen Landesamt für Umweltschutz und dem Landesbund für Vogelschutz in Bayern e.V., die Datengrundlagen. An dem Vorhaben waren über 600 ehrenamtliche Feldornithologen beteiligt. 1996 wurde mit denersten Erhebungen begonnen, die sich über insgesamt drei Jahre erstreckten. Als Rastergröße wurde ein TK25-Quadrant festgelegt. Die Vorkommen von Rote-Liste-Arten wurden durch punktgenaue Geländeaufnahmen mit zusätzlichen Angaben zum besiedelten Lebensraum gesondert erfasst. Die Herausgabe des Atlasses erfolgte, nach Abschluss der von den zahlreichen "Artredakteuren" und den Hauptredakteuren Dr. Einhard Bezzel, Ingrid Geiersberger, Günter von Lossow und Robert Pfeifer geleisteten gewaltigen Redaktionsarbeiten, im Jahre 2005. Der Atlas ist als Buch beim Ulmer Verlag erschienen mit dem Titel: Bezzel, E., Geiersberger, Il, Lossow, G.v. und Pfeifer, R. (2005): Brutvögel in Bayern. Verbreitung 1996 bis 1999. Stuttgart: Verlag Eugen Ulmer, 560 S. ISBN 3-8001-4762-9.